Вирусы — самые частые нарушители спокойствия в нашем теле. Они ответственны за целую плеяду разнообразных заболеваний, от обычной простуды до SARS-CoV-2 и СПИДа. Они хорошо приспосабливаются к большим организмам, и коронавирус — яркий тому пример.
Вероятно, в скором времени нас может ждать пополнение. Анализ планктона из разных частей океана выявил тысячи ранее неизвестных вирусов. Хуже того, это РНК-вирусы — в отличие от собратьев, встраивающихся в ДНК, они плохо изучены и несут дополнительные риски для человека:
Мы проанализировали глобальную базу данных последовательностей РНК из планктона, собранных в ходе четырехлетнего глобального исследовательского проекта Tara Oceans expeditions. Планктон является жизненно важной частью пищевых сетей океана и отличным переносчиком для РНК-вирусов. В результате нашего исследования было выявлено более 44 000 генов, кодирующих белок вируса.
Следующей задачей было определить эволюционные связи между этими генами. Чем более похожи два гена, тем более вероятно, что вирусы тесно связаны. В изучении учёным помогло машинное обучение — компьютеру «скормили» много данных о вирусах и новое исследование, а он сам систематизировал последовательности и выявил различия. Плюс он сделал это более точно, чем если бы эта задача решалась вручную учёными.
Мы идентифицировали в общей сложности 5 504 новых морских РНК-вирусов и удвоили число известных типов РНК-вирусов с пяти до десяти.
Эти новые последовательности помогают ученым лучше понять не только эволюционную историю РНК-вирусов, но и эволюцию ранней жизни на Земле. И, конечно, новые вирусы можно изучить на предмет их опасности для человека — и заранее подготовить теоретическую базу для создания вакцин от «вирусов глубин».