Разговор Архитектора с Нео в «Матрице: Перезагрузка» дал ответы на многие загадки Матрицы. В том числе на вопрос о том, сколько версий симуляции было до событий фильмов.
Первые два цикла Матрицы, задуманные как рай, были абсолютным провалом. Машины не смогли предвидеть, что человеческий разум отвергнет идеальный мир, и что люди сразу увидят, что с раем что-то не так. В результате многие люди начали выходить из симуляции.
Машины поняли, что в Матрице должны быть недостатки, что-то, что имитирует реальную жизнь. Поэтому симуляция, о которой идет речь в последующих фильмах, в значительной степени является реконструкцией реального мира, где люди вынуждены заниматься обыденными делами, например, ходить на работу.
Начиная с третьего цикла люди стали гораздо реже осознавать, что они находятся в симуляции. Даже Нео, которому было суждено стать Единственным, не совсем понимал, почему он чувствует, что что-то не так. Фактически, во всем каноне есть только два персонажа, которым удалось выбраться из симуляции без посторонней помощи — без чего-то вроде красной таблетки Морфеуса.
В «Матрице» не так много говорится о четвертом и пятом циклах. Однако можно сделать вывод, что это были самые стабильные циклы Матрицы по сравнению со всем, что происходило раньше и что произойдет в шестой итерации.
В «Перезагрузке» объясняется, что Нео был не второй версией Единого, как считал Морфеус, а скорее шестой. Это позволяет считать, что действие оригинальной трилогии «Матрица» происходит в шестом цикле «Матрицы». До Нео было пять версий Единого, по отдельности для каждого цикла, но все их истории заканчивались одинаково.
Переделки Матрицы закончились с началом седьмого цикла, в котором люди могли свободно покинуть Матрицу, если пожелают. Оракул и Сати были частью этой новой, почти утопической, симуляции.
Действие «Воскрешения» происходит через 60 лет после окончания трилогии. Свобода воли была удалена, а многие ключевые программы из оригинальной трилогии были сокращены — в том числе Оракул и Архитектор. К счастью, Сати пережила конец оригинальной Матрицы и смогла помочь Ниобе и Нео найти Тринити в будущем.