23-летний футболист является воспитанником петербургского клуба, также ранее он выступал за «Томь», «Новосибирск» и петербургскую «Звезду».
В прошлом сезоне Крапухин выступал в составе «Зенита-2» в Олимп-ПФЛ, забив 19 мячей.
В составе основной команды на счету игрока три матча в Тинькофф РПЛ.