Фанатская теория предполагает, что после событий оригинальной трилогии технология Матрицы стала еще более продвинутой и опасной.
Фильм «Матрица: Воскрешение» покажет, что произошло через двадцать лет после трех первых частей. Нео живет, казалось бы, жизнью обычного человека под именем Томаса Андерсона — так его раньше звали и в симуляции. Неясно, где же он находится: в созданном компьютерами сне, в Матрице внутри Матрицы или в глубинах кода, созданных остатками его разума.
Фанаты считают, что новая версия Матрицы способна клонировать людей — и Тринити, которую Нео видит в трейлере, является просто клоном без воспоминаний оригинале.
А еще изменилось и само отношение к жизни в Матрице. В одной из сцен трейлера Нео спокойно выбирает синюю таблетку (симуляцию) — быть может в новой версии Матрицы люди осознают, что живут в виртуальном мире, однако их это не беспокоит. Возможно, они ищут там убежища?
Кроме того, в оригинальной трилогии понять, где реальность, а где симуляция можно было по цветовой палитре — мир симуляции был в сине-зеленых оттенках. В «Воскрешении» же такого различия нет. Чем вызваны такие визуальные изменения неизвестно — скорее всего, ответ на этот и другие вопросы мы узнаем в декабре, когда четвертая часть «Матрицы» выйдет на экраны.